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细胞裂解液配方和选择

1►   细胞裂解液的目的

(1)利用去垢剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;

(2)溶解蛋白;

(3)蛋白变性使其稳定;

(4)抑制蛋白酶活性。

 

常见的细胞裂解液成分:

50mM Tris-HCl pH7.4       (缓冲体系)

150mM NaCl                (等渗体系)

1mM PMSF                  (蛋白酶抑制剂)

1mM EDTA                  (变性剂和稳定剂)

5μg/ml Aprotinin          (蛋白酶抑制剂)

5μg/ml Leupeptin          (蛋白酶抑制剂)

1% Triton X-100             (弱变性剂)

0.1% SDS                    (强变性剂和溶解剂)

1% Sodium deoxycholate   (中度变性剂和溶解剂)

 

2   细胞裂解液的一般成分

1. 裂解成分:破坏细胞膜裂解组织或细胞。裂解强度:SDS(基本会使蛋白变性失活) > Triton X-100 > NP-40

英文名中文名裂解强度和去垢剂类型作用
SodiumDeoxycholate脱氧胆酸钠中度;阴离子型能够有效破坏多种蛋白间的相互作用
1%Triton X-100曲拉通X-100温和;非离子型溶解脂质,增加细胞膜的通透性
0.1%SDS十二烷基硫酸钠强;阴离子型强变性,极易促溶,能够有效破坏多种蛋白间的相互作用
1%NP-40乙基苯基聚乙二醇温和;非离子型可破坏掉细胞膜,获得胞浆蛋白,对核膜的破坏作用较弱

2. 蛋白酶抑制剂:抑制蛋白酶的活性,避免蛋白过度降解。

英文名中文名作用
PMSF苯甲基磺酰氟抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶
Leupeptin亮肽素抑制丝氨酸和半胱氨酸蛋白酶
Aprotinin抑肽酶抑制丝氨酸蛋白酶
Pepstatin胃酶抑制剂抑制天冬氨酸蛋白酶、多种微生物酸性蛋白酶
EDTA-Na2乙二胺四乙酸多数核酸酶和有些蛋白酶需要金属离子激活酶的活性,EDTA可螯合金属离子,抑制酶活

3. 磷酸酶抑制剂:抑制去磷酸化作用。

英文名中文名作用
NaF氟化钠抑制去磷酸化作用
Na2VO4钒酸钠抑制去磷酸化作用
Beta-glycerophosphateβ-甘油磷酸酯抑制去磷酸化作用
Na2PO4磷酸钠抑制去磷酸化作用

* 可根据目的蛋白的特性对裂解液配方做出调整,例如:非磷酸化蛋白可不添加磷酸酶抑制剂;IP背景高,选用裂解度高的裂解液;目的蛋白IP 不下来,选用裂解度低的裂解液等等。

1.细胞裂解液影响细胞膜和核膜的破坏效率, 所以应根据目标分子在细胞内的定位选择裂解液。此外,不同的细胞和组织具有不同的膜组成和结构,需要针对其特性选择特定裂解液。使用错误的细胞裂解液可能导致细胞裂解不完全,进而影响数据的准确性。
2.适当的裂解液对于维持细胞内目标分子的稳定性和完整性至关重要。例如,在核酸研究中,裂解液会影响RNADNA及其修饰的完整性。在蛋白质组学中,它影响蛋白质和翻译后修饰的稳定性。使用错误的缓冲液可能导致这些分子的降解或变性,从而损害下游分析的准确性。
3.细胞裂解液对试验结果的一致性有重要的影响。不同的缓冲液pH值、离子强度和去垢剂不同,这些因素可能影响酶、蛋白质和其他细胞组分的结构和活性。保持缓冲液一致性对于确保实验的可重复性至关重要。

 

 

4.选择错误的裂解液会造成样品中无目的蛋白情况,例如目的蛋白为核蛋白时请勿使用NP40 这类温和的裂解液。

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如果是分泌型蛋白,例如细胞因子或趋化因子等,组织或者细胞的裂解液可能并不能直接反映目的蛋白的表达水平,一方面可以通过刺激处理促进其胞内表达,另一方面可以尝试ELISA或者Luminex 多因子检测等实验方法对细胞上清液或者生物体液等进行检测。此外,样本收集及保存过程中,需要考虑目的蛋白降解的风险,建议使用新鲜的裂解液对新鲜收集的样本进行蛋白提取,并确保裂解液中蛋白酶抑制剂及磷酸酶抑制剂活性,防止蛋白降解。样本尽量低温保存,并避免反复冻融。

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